Rikudou descobriu o Chakra. Logo, creio que tenha desenvolvido e controlado todas as naturezas de chakra e seus respectivos jutsus, fazendo dele um cara tão forte a ponto de ser o único a ter um poder capaz de aguentar um embate contra o Juubi, que detinha o poder dos 9 bijus. Ou seja, ambos tinham um poder além da compreensão, muito maiores que os de qualquer shinobi que vimos.
Penso que o Rikudou só não tinha o poder dos Doujutsus (Técnicas oculares). Os Doujutsus Rinnegan e Sharingan são provenientes do Juubi. Conforme mostrado em sua primeira aparição no capítulo 467, Juubi é um ciclope, cujo olho é uma fusão do Rinnegan e do Sharingan.
tobi menciona tbm no capítulo 467 que o Rikudou foi o Jinchuuriki do Juubi. Como sabemos, os Jinchuuriki podem controlar o poder dos Bijus e usá-los, tendo como grande exemplo o treinamento do naruto e o fato do Bee controlar o poder do Hachibi. Mesmo sendo o Juubi, creio que o Rikudou tenha conseguido controlar um pouco do poder do Juubi, e foi a partir dai que Rikudou obteve o poder do Rinnegan.
Só lembrando, essa parte é fundamentada por não sabermos exatamente se o Rikudou possuia o Rinnegan antes de lutar com o Juubi. Em sua primeira aparição (cap. 462 acho), sua silhueta é mostrada com o Rinnegan, mas não da pra afirmar se essa imagem é de antes ou depois de enfrentar e selar o Juubi em si mesmo, até porque na primeira aparição do Juubi (foto acima) o Rikudou tá de costas.
O primeiro Rinnegan, do Rikudou, foi obtido através do poder do Juubi.
O filho mais velho do Rikudou nasceu com os olhos do pai. Mas na verdade, o doujutsu passado do Rikudou não pode ser chamado de Rinnegan, pois já havia sofrido sua primeira mutação. No Rinnegan não é possível diferenciar as partes do olho, pois todo ele é formado de circulos e é roxo. Como destacado no episódio 203 do Shippudenn, a esclera do filho mais velho é visível (parte branca) e somente a córnea tem o formato do Rinnegan. Sendo assim, não vamos considerar que o filho mais velho tinha o Rinnegan, e sim uma mutação dele.
Dessa mutação originaram-se o Sharingan (com toda certeza) e o Byakugan (hipótese). Não discutiremos aqui a origem do Byakugan, mas o Sharingan é importante para a teoria. Entretanto, o Sharingan não pode ser considerado como uma mera mutação do Rinnegan, pois tem características presentes no doujutsu original (olho do Juubi). Sendo assim, podemos dizer que o Rinnegan do Rikudou era uma parte do doujutsu original, e ao longo do tempo, por alguma razão, foi perdendo suas características e se transformando na outra parte do doujutsu original, que é o Sharingan. Importante frisar que o Sharingan NÃO é uma mutação do Rinnegan como o Kakashi afirmou.
Sendo assim, não houve indício de que alguém possuiu o Rinnegan puro após o Rikudou. Até a aparição de Uzumaki Nagato. Existem várias discussões a cerca da origem do clã Uzumaki, e NESSE TÓPICO foi mostrado de forma clara que dois Uzumakis (Nagato e Naruto) mostraram características do Rikudou. Isso não é especulação, é fato. E apoiando-se nisso, vamos considerar que os Uzumaki são descendentes do filho mais novo assim como o clã Senju.
