Vou citar as mais importantes e que certamente farão com que a série e os livros sejam MUITO diferentes. Spoilers dos livros e da série no meu post.
-Aegon VI Targaryen, o provável opositor da Daenerys e que já está em Westeros (conquistou Ponta Tempestade), foi cortado da série. Isso também afetou as motivações do Varys e o arco do Tyrion na quinta temporada.
-Morte do Barristan não acontece nos livros. Na verdade, ele é nomeado Mão da Rainha e está liderando Meereen na ausência da Dany.
-Guerra de Meereen com Yunkai e Astapor foi provavelmente cortada ou jogada para a sexta temporada para que o Tyrion tenha alguma coisa para fazer.
-Lady Stoneheart (Catelyn), que captura Podrick como refém e faz com que Brienne vá até o Jaime para levá-lo até ela, também foi cortada.
-Arianne Martell, personagem principal de Dorne e herdeira do Doran, cortada. Quentyn Martell, irmão de Arianne, viaja para Meereen e liberta os dragões da Dany nos livros. Na série, cortado.
-Stannis vivo nos livros, Lordes do Norte e Jeyne Poole cortados, assim como alguns vassalos do Stannis. Selyse e Shireen também estão vivinhas na Muralha.
-Quase que 100% dos personagens do Vale foram cortados (Harry, Myranda, Mad Mouse, etc), assim como o arco da Sansa e do Mindinho lá. O plano de transformar Sansa na Senhora do Vale através do casamento com o Harry também foi para o saco.
-Prováveis cortes de Victarion Greyjoy e Aeron Greyjoy.
Em termos de enredo, acho que são as principais diferenças.
