Sim. Inclusive, o perfil do Sasuke no Databook 4 fez essa confirmação sem rodeios:
Não que isso fosse estritamente necessário. O mangá sempre deixou claro que o Sasuke iria superar o Itachi desde os seus primórdios e várias comparações entre eles foram feitas no decorrer da obra. Além disso, os irmãos possuíam o mesmo conjunto de habilidades, então a tarefa de compará-los é bem simples e direta. A técnica mais poderosa que o Itachi possuía sem arriscar a própria vida era o Amaterasu, um poder que o próprio Sasuke também possuía para fazer par com uma outra ainda mais poderosa: o Kagutsuchi.
No que diz respeito às técnicas exclusivas deles, o próprio Itachi admitiu em mais de uma ocasião que o seu Tsukuyomi não era tão decisivo contra oponentes que possuíam os mesmos olhos, que dirá mais poderosos. Por outro lado, o Kirin do Sasuke sempre é uma arma mortal para seu irmão mais velho, que seria obrigado a utilizar o Susanoo para sobreviver. E no caso do Itachi, o Susanoo é uma faca de dois gumes, algo com potencial para derrotar o adversário, mas que também pode matar o próprio usuário enquanto estiver em uso.
Já em matéria de estamina/saúde, a vantagem do Sasuke é muito grande. Ele poderia usar as técnicas do seu Mangekyou Sharingan à vontade sem qualquer risco de desenvolver cegueira ou sofrer dores intensas pelo corpo, enquanto o Itachi só poderia usar essas técnicas estritamente quando fosse necessário. Seria como o Obito debochando do Kakashi porque o Jounin só era capaz de lançar o Kamui por um número limitado de vezes. O Sasuke ainda possui outras vantagens, como uma invocação muito mais poderosa e um conjunto de técnicas que, no geral, supera o arsenal do Itachi.
Além disso, há outros fatores que podem influenciar na análise. O Itachi foi apresentado como um Uchiha no auge da maturidade. Ele já era um mestre do Mangekyou Sharingan quando enfrentou o Kakashi e os outros Jounins na Folha. Na época que enfrentou o Sasuke na batalha final deles, já estava totalmente acostumado com seus próprios poderes, conhecia seus pontos fortes e fracos. Por outro lado, sempre vimos o Sasuke em momentos de adaptação aos seus novos poderes, como um jovem que recém-despertou o Sharingan e o Mangekyou Sharingan e, por vezes, utilizava técnicas novas pela primeira vez na vida durante o calor do combate. Na batalha contra o Kabuto, por exemplo, vimos um Sasuke que havia começado a usar o Mangekyou Sharingan Eterno há poucas horas. Bastaram apenas mais algumas horas para ele desenvolver o Susanoo para o nível que o Madara costumava utilizar. Imagine o que ele poderia fazer com mais alguns dias, meses ou anos de experiência com o Doujutsu. Não tenho dúvidas de que poderia ter se tornado o Uchiha mais poderoso da história mesmo sem o Rinnegan.
Em uma situação de batalha, acredito que o Sasuke é bem superior no geral. Seu conhecimento sobre o arsenal do irmão é praticamente completo, enquanto o Itachi seria surpreendido pelo seu caçula sendo capaz de controlar as chamas do Amaterasu, não sofrendo com os efeitos colaterais do Mangekyou Sharingan, bloqueando o Tsukuyomi, entre outras eventuais vantagens. É difícil imaginar a vitória do Itachi mesmo se ele tivesse conhecimento prévio sobre tudo isso, só conseguiria vencer com muito preparo mesmo.