Depende se for o Naruto que enfrentou o Neji, vejo uma grande chance de ele sair vitorioso. O chakra da Kyuubi da a ele uma velocidade que o Shino nem quase ninguém daquele exame conseguiria acompanhar, além de que duvido muito que os insetos entrariam na aura da kyuubi e ficariam bem.
Ao mesmo tempo que não quer dizer que o Shino perderia feio, entre os genins da epoca ele era um dos mais fortes, se fosse por exemplo contra o Naruto que enfrentou o Kiba, ele venceria com extrema facilidade.
Tier de poder dos genins do exame parte 3:
Tier 1: Naruto, Sasuke e Gaara.
Tier 2: Neji e Shino.
Tier 3: Shikamaru, Temari, Kankuro, Dosu.