Nawaki e Obito devem ter morrido mesmo.Mas se pode ser Obito,pode ser o Senju:
1-Poderia ter implantado e aprimorado o Sharingan.Kakashi fez isso e como Nawaki é Senju,as chances disso acontecer com ele são maiores.
2-Quando Tsunade ficou ciente da morte do irmão,Orochimaru disse que o corpo estava irreconhecível.E como mestre dele,havia percebido nele talento.Queam sabe quando o garoto recebeu o ataque,o Sannin trocou-o com outro genin?Dessa maneira,faria suas experiências sem ninguém saber.
3-Tobi e Tsunade jamais se encontraram.Se ele fosse um Uchiha,teria ódio dela por seu sangue Senju e tentaria de tudo pra acabar com a raça dela.Mas eu nunca ouvi sequer ele tocar no nome dela.
4-Nawaki sempre sonhou em ser hokage.Orochimaru poderia ter distorcido a personalidade dele com seus joguinhos mentais a ponto dele passar a querer dominar não só a aldeia,mas o mundo.
5-Kabuto não reviveu Nawaki,o que poderia abalar drasticamente a hokage.
6-Se Orochimaru o tirou da aldeia, poderia esse ser o motivo de ter feito parte da Akatsuki.Só que ao ver que o poder dele estava fugindo ao seu controle,tentou roubar o Sharingan de Itachi,fracassou e fugiu.