Gente, NÃO EXISTE NADA disso do "Amaterasu se formar em cima do Ninja", Amaterasu não é o Kamui.
Antigamente, tinhamos a impressão de que o Amaterasu se formava em cima do cara, mas o Zetsu explicou muito bem sobre isso aqui:
Zetsu disse muito bem ali: Ele queima o que o olho tiver em foco... As chamas negras irão convergir nesse exato ponto.
O que é convergir? É dirigir-se a um ponto exato, e realmente, o Amaterasu faz um trajeto RÁPIDO do usuário até o alvo, é tão rápido e inaceptível, que nem dá pra notar.
Porém, se revermos com mais atenção quando o Sasuke usa o Amaterasu no Hachibi, podemos ver que a partir do momento que o Sasuke ativa o MS as imagens vão se aproximando pouco a pouco do Hachibi, o mangá DÁ MUITA ÊNFASE nesse efeito como se estivesse acontecendo um "trajeto" ali, tanto que quando finalmente a imagem se aproxima do Hachibi, as chamas se formam em cima dele.
É só revermos também quando ele usa o Amaterasu contra o A, se a técnica se formasse EM CIMA da onde ele foca a sua visão, as chamas teriam ficado no local onde o A estava, ao invés de percorrem um percurso e só pararem no Samurai que estava ATRÁS DELE.
Da mesma forma que se o Amaterasu se formasse em cima do Ninja, as chamas teriam se formado EM CIMA do Kazekage, ao invés de TEREM SIDO BARRADAS PELA DEFESA AUTOMÁTICA DE AREIA.
A verdade é que Madara com o Susano, se defenderia tranquilamente do Amaterasu, as chamas NÃO IRIAM chegar até ele com êxito.
Fora que ainda não temos muitas informações sobre o funcionamento da Gunbai, mas como ela mostrou que pode "tankar" efeitos de Ninjutsus, e revertê-los contra o usuário, é bem provável que a Gunbai possa inutilizar o Amaterasu.
E sobre ele ativar o Susano a tempo, o Madara tem o Sharingan mais treinado e no estágio mal alto que temos notícias, por consequência disso, sua percepção é grandemente aumentada ao ponto de conseguir até mesmo distinguir BUNSHINS num olhar, se o Itachi conseguiu ativar o Susano ANTES de ser pego pelo Kirin ( Que é algo mais rápido do que o Amaterasu ), por que o Madara não poderia ativar o Susano antes do Amaterasu chegar até ele?