Acho que não tem nada a ver não.
O Selo Yin é apenas uma espécie de reservatório de chakra, tanto é que a Sakura e a Tsunade conseguem acumular chakra nesse selo durante anos.
E quando precisam, utilizam o Infuuin: Kai (Liberar o Selo Yin), para poderem utilizar o chakra armazenado, seja para aumentar a força, ou para utilizar jutsus regenerativos, como o SS e o Byakugou.
Já o SM tem um conceito diferente,
Enquanto que o Selo Yin armazena o próprio chakra do Ninja, o Modo Sennin absorve e armazena o chakra da Natureza. Só que diferente do Selo Yin, o SM não armazena o chakra por grandes períodos de tempo, já que o armazenamento de chakra, devem ter sempre um equilibrio entre energia Física, Mental e a Natural, do Senjutsu.
Então, ambas são diferentes sim entre si.
E no meu contexto, não são interligadas em nada.