Não tem como imaginar o mundo ninja sem Biju's.
Os Biju's vieram do Juubi, que é o guardião da árvore da qual a princesa roubou a fruta e descobriu o Chakra.
Se a princesa não tivesse roubado a fruta, não teria descoberto o chakra e não existiriam os shinobis. Se tudo ocorresse naturalmente, ela roubaria a fruta, o Juubi iria atrás dela, um tempão depois o Rikudo Sennin derrotaria ele e o dividiria em 9 partes, como fez. Não há outro destino se não esse, a meu ver.
Não existiriam os shinobis, mas continuariam havendo guerras. Elas já existiam antes da princesa Kaguya descobrir o Chakra.
Então, daria na mesma, com Biju's ou sem Biju's. Não sei dizer de qual jeito seria melhor.