Se formos analisar bem, o Shippuuden se resume a "caçada" do Naruto atrás do Sasuke. A maioria dos eventos acontecidos no mangá foram causados por essa busca do Naruto. Não posso nem falar busca, mas sim convicção.
Então é evidente que o mangá não seria a mesma coisa de agora pelos seguintes fatos:
A - Naruto ficaria ressentido e fraco para poder lutar, pois perderia um "amigo" e um mestre em datas bem próximas.
B - Itachi teria falhado por proteger seu irmão e não teria motivos para ainda continuar na Akatsuki.
C - Obito (Tobi) teria a chance para batalha pelos olhos de Itachi e talvez ele poderia ter êxito.
C.A - Obito poderia contar a verdade sobre Itachi para Nagato e fazê-lo destruir Itachi.
D - Nagato invadiria Konoha com Naruto fraco para a luta.
D.A - Konoha poderia ser tomada com o Naruto fraco e tornar-se um centro da Akatsuki.
E - Obito iria pessoalmente atrás do Hachibi (ou mandaria Kisame até lá).
E.A - Kisame pegaria a Hachibi para Obito (pode ser que consiga, pois o Bee se salvou por causa do Raikage).
F - O plano olho da lua seria ativado.
G - O mundo seria controlado por Obito.
Isso são apenas suposições e nada de concreto, pois não podemos adivinhar as reações do Naruto ao saber da morte de pessoas queridas para ele. Assim, podendo existir várias possibilidades de reações, emoções ou sentimentos expressos durante o mangá.
Mesmo assim, era bem óbvio que o Sasuke sobreviveria, pois mangá sem um antagonista principal, não é mangá.
Ellos, você fumou arroz? O Deidara estaria morto com o Sasuke.