Bom eu vou tentar responder pelo oque eu entendi da sua descrição. Eu entendi que a guerra é entre as 5 nações, todos contra todos, e que vença o melhor. Se for assim...
Quem Venceria a Guerra na minha opinião?
- Konoha
Porque?
- (Protagonista no Jutsu KKKKKKKKK, Brincadeira), A vila da folha sempre é citada como a mais poderosa vila oculta entre as 5 grandes nações. Esse é um primeiro ponto. O segundo ponto é maior variedade de habilidades que Konoha tem quando avaliada em conjunto (Linhagens do clã Aburame, Inuzuka, Hyuuga, Uchiha, Akimichi, Yamanaka, Senju, Sarutobi.... Fuinjutsu, Kinjutsus, Selos como o Hiraishin... e por ai vai. e Terceiro e último, Pelo Mapa do Universo de Naruto, o país do fogo está bem localizado: tem saída pro mar, fronteira com possíveis aliados (Países menores), Vantagem logística pra transposição de armas, Tropas, Mantimento e acampamentos.
Quem sobreviveria?
- Acho que o Neji, não seria o único da "panelinha dos 11" a rodar...
Creio que seria os mais fortes e habilidosos (Kakashi, Gai, os ANBU's e etc.), dos 20 mil soldados de Konoha, penso que 90% passaria pelos portões do inferno.
E por último, quem daria mais dificuldade, os que sobrevivessem