Nagato não é/foi mau. Muito pelo contrario, ele só seguia sua paixão que era a paz.
Naruto mesmo fala pro Obito, que Nagato era diferente do Obito.
Naruto disse que Nagato
realmente queria/buscava a paz.Se ele achasse outro meio de alcançar a paz, ele faria ué, assim como fez acreditando o Naruto.
Se ele fosse o Jin do Juubi, ele ficaria do bem, de boas.
Em relação ao Madara. Pode-se considerar que o Manga já tinha acabado.