Boto Susano'o Full e Kamui e Onmyouton como os melhores, Susano'o pelo motivo já citado aí, o dano que ele causa, seu tamanho e sua resistência.
Kamui atual pra mim é outro que é um dos melhores, o olho direito e esquerdo juntos, meol deus, uma pessoa assim pode ser invencível numa luta sem conhecimento.
E Onmyouton porque anula qualquer ninjutsu.
EDIT: Achei que perguntava qual eram os melhores jutsus do mangá, mas entre esses aí, o Susano'o é o melhor