1.Clã Senju - Este clã descende do filho mais novo do Rikkudou Sennin. Possuem enorme vitalidade, energia física, um chakra enorme, e alguns entre eles despertam habilidades únicas e são tratados como melhores naquilo que fazem.
Tobirama era o ninja mais veloz de sua época, Hashirama possuía uma habilidade única o Mokuton e era o shinobi mais poderoso de sua época, Tsunade a melhor médica ninja do mundo.
2.Clã Uchiha - Os Uchihas descendem do filho mais velho do Rikkudou. Possuem grande energia espiritual e podem despertar o Sharingan, que é o Doujutsu que vem anteriormente a evolução para o Rinnegan, com ele é possivél ver o fluxo de chakra do oponente, prever movimentos, copiar técnicas do adversário...
O Sharingan pode evoluir ainda para Mangekyo Sharingan e Eien Mangekyo Sharingan. Uchihas tem afinidade natural no uso de Katon, tendo ele como elemento principal. Surgiram muitos shinobis talentosos dentre os Uchihas.
3.Clã Uzumaki - O Clã Uzumaki possui um chakra invejavél e grande vigor físico, possuem um conhecimento avançado em técnicas de Selamento, além de serem hospedeiros perfeitos para bijuus.
4.Clã Hyuuga – É um dos clãs mais nobres e poderosos de Konohagakure. Possuem o Byakugan, doujutsu capaz de observar o fluxo de chakra do oponente com um precisão maior que a do próprio Sharingan, através de seus olhos podem observar muito além em longas distâncias.
Os Hyuugas desenvolvem ainda seu próprio estilo de Taijutsu, o Juken podendo fechar todos os tenketsus do oponente, e possuem a defesa suprema no mundo shinobi.
5.Clã Juugo – Se sabe pouco sobre esse clã ou quase nada, exceto que ele podiam utilizar Senjutsu de forma natural, característica mostrada por Juugo, dessa habilidade, mais tarde veio a se originar o Selo Amaldiçoado baseado nas pesquisas de Orochimaru.
6.Clã Kaguya – Foi um clã de Kirigakure. Segundo o mangá, esse clã foi totalmente destruído por se tratarem de brutais, fanáticos pelas guerras, pelas batalhas o que levou a extinção do clã.
Seus integrantes despertavam uma KG muito especial, Shikotsumyaku, graças a ela eles podiam manipular a sua estrutura óssea como bem entenderem, demonstrado por Kimimaro que era o último sobrevivente do clã, mas morreu por uma doença.
7.Clã Hoozuki – Um clã de Kirigakure. O Clã Hoozuki é um dos clãs mais especiais de Kiri, possuem uma habilidade que permite se liquifezar, o Suika no Jutsu, possuem afinidade com o Suiton.
8.Clã Sarutobi – Um clã dos mais fortes clãs de Konohagakure. Sabe-se que os Sarutobis foram um dos primeiros clãs a se juntar á Konoha na época de sua criação ao lado dos Shimuras, e permanecem até hoje.
Alguns shinobis do clã Sarutobi ocuparam cargos importantes como o falecido Hiruzen, hokage a mais tempo no poder, parecem possuir afinidade com Katon, como mostrado na guerra atual.
9.Clã Akimichi/Yamanaka/Nara – Estes clãs estão interligados por várias gerações em Konoha. Os Akimichis possuem uma força enorme, são robustos e dominam com grande perícia o Baika no Jutsu podendo expendir seus membros ou seu corpo inteiro como bem entenderem.
Os Yamanaka possuem técnicas mentais poderosas, são capazes de se conectar mentalmente com uma pessoa ou com várias simultaneamente, são qualificados em técnicas de sensoriamente.
Os Nara constituem um dos clãs mais inteligentes de Konoha, além de dominarem o Kagemane no Jutsu, técnica de Possesão da Sombra, também guardam segredos sobre técnicas medicinais avançadas dentro de seu clã para as seguintes gerações de ninjas médicos de Konoha.
10.Clã Aburame/Clã Inuzuka – Os Aburames possuem a habilidade de utilizar insetos em batalha. Os membros do clã se tornam hospedeiros de um tipo de inseto, o Kikai com o qual ficam conectados para sempre, eles podem utilzá-los das mais diferentes formas, rastreando o chakra do inimigo e se alimentando dele.
O Clã Inuzuka utiliza-se da ajuda de Ninkens em suas batalhas, cada membro tem seu proprio companheiro canino, possuem um estilo mais selvagem, e geralmente trabalham em parceria com os seus Ninken em batalha, utilizando um taijutsu composto de técnicas conjuntas com seu cão.
Os clãs são um dos meus temas preferidos em Naruto...