Ela reabasteceu ele com o seu Chakra para que ele pudesse voltar de lá com o Kamui, já que ele não tinha mais.
A Kurama faz isso logo depois de o Kakashi explicar que a dimensão do Kamui do olho dele e do Obito eram as mesmas e depois de entender como funciona a intangibilidade do Obito, basicamente ele envia partes de seu corpo que serão atingidas por um ataque para a Kamuiland. Enquanto o Naruto atacava da dimensão real o Kakashi atacava da outra, assim eles acabaram encurralando o Obito, como você deve ter visto...
Basicamente é isso, ela deu um pouco de seu Chakra a ele através daquele toque, para que ele voltasse da Kamuiland quando quisesse.