Parece que ela só pode ser selada. Assim como o Juubi, cortar um montante de chakra não resulta em nada. Claro que ainda dá para matar até o Jinchuriki do Juubi, mas devido às capacidades aprimoradas da Kaguya, pode-se dizer que é impossível mata-la, sendo que nem Hagoromo e Hamura foram capazes de tal.
Trancar é o mesmo que selar. Selar é a forma mais segura de prender alguém; Porém, algo que nem todos se lembram é disso: Os selamentos são classificados conforme sua força. O da Kurama quando enfraqueceu e permitiu a sua saída, provou isto. Além da fala dos próprios personagens que selarão a Kaguya, de que o selamento é muito forte.
Então é bem possível que apenas o combo de Hagoromo (Naruto e Sasuke) consigam tal feito. Eu também acho que as armas do Rikudou, o Kohaku no Johei por exemplo, seria capaz de sela-la, apenas adicionando um chakra "á mais" para reforçar.