Todo jutsu tem sua potência de acordo com o chakra adicionado à ele. Um Chibaku Tensei do Rikudō Sennin foi capaz de criar a Lua, mas Sasuke e Nagato não conseguiriam fazer o mesmo porque não possuem tanto chakra e não possuem um chakra tão poderoso como o Hagoromo.
Portanto, o mais correto é avaliar as técnicas em si, pois em potência, os usuários do Rinnegan se mostraram muito mais poderosos, que são Hagoromo e Madara (Jinchūriki).
O Rinnegan de tomões do Sasuke possui um teletransporte muito eficaz, capaz de fazer o corpo de seu usuário trocar de lugar com um objeto ou até mesmo outro corpo. Além de não precisar de marcações, é claro. Este Rinnegan também lhe dá acesso ao Chibaku Tensei.
Mais recentemente, o Rinnegan de tomões do Uchiha foi usado para prender as 9 Bijūs de uma só vez em um genjutsu que as paralisou por completas, e este genjutsu foi aplicado sem foco, em outras palavras, nas do Rikudō Sennin: "E ele conseguiu só de olhar de relance." E isso dá a entender que as capacidades oculares deste Rinnegan são superiores a qualquer outro dōjutsu já mostrado.
Porém, acho que o Rinnegan comum, sem tomões, é mais versátil por todas as habilidades que Madara e Nagato mostraram. Porém, o jeito é aguardar pois ao que parece, o Rinnegan de tomões também tem acesso as outras habilidades do Rinnegan comum.
E não faria sentido não ter, não é?
Então é isso. O Rinnegan de tomões aparenta ser mais forte, mas até agora se mostrou bem incompleto em relação ao sem tomões.