Bom vamos por partes....
1- Orochimaru, dividiu sua consciência nos selos amaldiçoados que ele mesmo criou.
2- Mesmo que seu corpo e mente fossem selados, ele poderia voltar de uns dos selos amaldiçoados.
3- Não há nada que comprove que o Kabuto sabia que o Orochimaru, foi selado na espada, e que o Orochimaru tinha deixado suas partes nos selos.
4- Se não me engano o Sasuke só descobriu isso porque leu o pergaminho que o Juugo e o Suigetsu encontraram.
5- E além que o objetivo do Kabuto era ter o Sasuke, não se sabe bem ao certo pra que, mas acredito que o Kabuto pensava que o Sasuke ainda tava com o Selo e o Orochimaru preso dentro dele.
6- Kabuto não tinha a consciência, tinha as células do Orochimaru.
7- Orochimaru não pode ver oque acontece fora do selo, ele é somente ''guardado'' la dentro, tanto que ele só descobre tudo que aconteceu depois que pegou seu Chakra de volta do Kabuto.
Para mim não foi KNJ, e sim uma jogada de Mestre, como um plano B.
Imaginem se o Itachi não consegui-se selar o Orochimaru ali, seria vitoria do Orochi e derrota do Zetsu que teria que esperar a próxima reencarnação de Indra.
Itachi já estava acabado.
Sasuke também.
Pein( Nagato ) seria convertido e morto.
Kisame iria logo Morrer.
Não teria Sasuke para ser manipulado.
Danzou, não se sabe qual seria o seu destinho, a menos que Tobi iria querer o Olho do Shisui, ai teriamos uma luta.
Konan Vs Tobi, bom sabemos o resultado.
Não teria Kabuto para invocar Madara, a menos que Zetsu desse um jeito de controlar o Kabuto, antes de Saber do Orochimaru.
Obito não aguentaria dois Rinnegans como ele mesmo falou.
Se tivesse Guerra, os Zetsu logo seriam derrotados, Orochimaru como sempre lógico não se envolveria nessa guerra.
No Final, ainda de que algum modo Zetsu poderia controlar Obito e Reviver Madara, mas... Como reviver o Juubi, sem nenhuma parte do Oito e Kyuubi. Bom sabemos como Madara é, não duvidaria nada que no final poderia dar Kaguya de novo.
Bom esse seria um enredo alternativo, para vocês verem o Peso do personagem chamado Itachi na historia.