Se os spoilers forem corretos, se a origem dos Ootsukis for ligada aos Hyuugas, então creio que sim, a Kaguya seria a mistura destes dois clãs, porém herdou o sobrenome Ootsuki.
Sobre o sharingan na testa, este poder, o sharingan, seria algo despertado após ela comer o fruto da Shinju; seria basicamente:
Shinju: Bijuus + Mokuton + Sharingan.
Assim como Rin'negan: Mokuton + Sharingan.
Kaguya, metade Hyuuga e metade Ootsuki, teria comido o fruto da Shinju e despertado os poderes dela, então seria...
Kaguya = Byakugan (Hyuuga), Sharingan (Uchiha), Mokuton (Senju) e algo mais, talvez Shikkomatsu (Ootsuki).
Entre Hagoromo e Hamura os clãs teriam sido criados e recriados, recriado no caso o clã Hyuuga.
A única coisa que me deixa confuso é sobre Toneri ser descendente do Hamura. Talvez ele realmente seja, mas creio que dessa forma teria vindo um irmão que herdasse o Byakugan, coisa que Toneri não possui...
Enfim, ainda faltam algumas peças para este quebra-cabeça...