Contra o Mugen Tsukuyomi, o buraco é mais embaixo (bem mais).
Mesmo que o ser seja imune a Genjutsus Oculares (cegos, usuários do Sennin Mōdo das Cobras e usuários do Rinnegan), ainda há totais chances dele ser pego pelo Genjutsu do Rinne Sharingan. E ainda que ele possua olhos normais, ainda há chances dele não ser pego pelo Genjutsu.
Exemplos?
Hashirama, Tobirama, Minato e Hiruzen não foram pegos por serem cadáveres. O Edo Tensei não dá vitalidade ao revivido. A Shinju vai atrás de quem possui vitalidade e os prende juntamente com o Mugen Tsukuyomi. Nenhum deles era imune a Genjutsus, quem dirá um dessa potência, mas não foram pegos.
Todos os outros foram pegos, até mesmo os cegos. Então mesmo que um usuário do Rinnegan seja imune a Genjutsus Oculares, se a árvore o pegar, já era, ele ficará no Genjutsu eternamente até que alguém o cancele. Afinal, o Genjutsu é infinito, nem mesmo os jinchūrikis perfeitos são imunes.
Sasuke bloqueou a luz do Mugen Tsukuyomi, ok, mas, perceberam que ele diz ao Naruto: "Espere pela árvore"? Pois é. Ele não só estava bloqueando a luz, como estava protegendo a si e a seus companheiros da Shinju. O Mugen Tsukuyomi tem 2 formas de afetar suas vítimas. Sasuke burlou ambas.
Creio que seja necessário que a árvore o prenda, caso contrário, ele não ficará no Genjutsu. Revividos são a prova disto. Sendo assim, posso dizer que a Shinju é que é a responsável pela eficácia do Genjutsu. Só o Rinne Sharingan não é suficiente aparentemente.
Então não basta possuir o Rinnegan para ser imune a Genjutsus Oculares, é preciso lidar com a Shinju também.