É obvio que foi o Madara.
Ele só surrou toda aliança shinobi, humilhou os 5 Kages, bateu nas 9 Bijuus, bateu no Hashirama, arrombou literalmente o Tobirama, deixou o Minato cotoco de vez, deixou Naruto e Sasuke a beira da Morte, além de ter colocado o mundo todo pra dormir com o Mugen Tsukuyomi.
Ele teve até partes de comédia misturado com momentos fodas. Por exemplo:
"Com Susanoo ou sem Suusano?" O Madara da até uma escolha pro inimigo de como ele quer ser humilhado, com Susanoo ou sem Susanoo? kkkkk muito foda.
"Sendo somente eu, os mapas tem de ser redesenhados um pouco" ele falou isso depois de cortar as montanhas com o Susanoo Tengu na luta contra os 5 Kages.
"Essas são como gotas de chuva, mas um pouco mais grandes e pesadas" ele falou isso quando usou o Chibaku Tensei.
"Que adulto lua a sério com uma criança?" o Madara falou isso pro Onoki.
Enfim, nenhum outro vilão que teve em Naruto foi tão bom quanto o Madara.