Não entendi qual a duvida do tópico, é se o Itachi controla alguém com genjutsu ?
Com genjutsu do sharingan nv. 3 já seria possível fazer isso, o próprio Itachi no clássico colocou um genjutsu em uma mulher para seduzir o Jiraiya e na guerra colocou outro genjutsu no Kabuto para ele cancelar o Edo Tensei.
Sasuke por exemplo colocou genjutsu em um ninja de Kumo para ele dizer onde estava o Bee
Obito controlou um jinchuuriki perfeito e virou como mizukage por anos(?)
Sabe como o madara fez a Kyuubi ajudar ele ? Com um misero genjutsu de sharingan nv. 3
Pelo o que sabemos não seria necessário nem mesmo o Tsukuyomi ou K.A, qualquer genjutsu básico do sharingan já serviria para ele controlar alguém e o forçar a fazer o que ele desejasse, o único problema que foi dito no manga é que ele não conseguiria porque são muitas pessoas (aliança shinobi ainda tinha 40 mil ninjas vivos) e além disso, os batalhões estavam muito distantes uns dos outros, ou seja, mesmo que ele controle 100 pessoas em konoha, não daria para ele controlar ao mesmo tempo 100 pessoas em Suna.
Esses genjutsu de sharingan, do sharingan básico já controlaram de ninjas top a bijuus, então, não acho que deva ser subestimado