Acho que por não fazer parte do estilo dele , poucas técnicas de Mokuton favorecem o estilo dele , que é mais focado em taijutsu.
Mas se engana quem pensa que o Obito tinha um Mokuton level Zetsu , além de ser mais habilidoso ele tinha muito mais chakra que um Zetsu , e quanto mais chakra , maior o Mokuton.
Obito usou Mokuton na luta contra Kakashi e Naruto , foi por um breve momento e nem mesmo foi um Jutsu por assim dizer , mas ele podia sim usar Mokuton se quisesse.