Pelo que eu entendi desta cena, Mukai consegui dividir o Katon por ter sido capaz de ler o fluxo de chakra do Jutsu, bem como entender sua composição. Não podemos ignorar que os Hyuugas possuem o Byakugan, um doujutsu com capacidade quilométrica e que pode enxergar o Sistema de Chakra, então é totalmente plausível que seja possível visualizar o chakra presente em cada jutsu e entender sua composição. Portanto, se o Hyuuga for capaz de ler o fluxo de chakra do elemento, ele conseguirá encontrar seu ponto fraco e suprimir o jutsu.
O x de toda a questão é que deve haver uma variação na composição de elemental para elemental. Jutsus de Katon são todos iguais, eles só mudam o seu molde de chakra e método de execução de uma técnica para outra, mas são oriundos da mesma matéria prima: o user concentra seu chakra no peito, transforma-o em forma de combustão e expele fogo pela boca. Já nos jutsus de Fūton, Raiton, Doton e Suiton deve-se possuir outras formas de composição, bastaria conseguir decifrá-las. Resta saber se o Mukai foi capaz de entender o Katon do Shisui durante o combate ou se ele já era familiarizado com técnicas desta natureza.
Não vejo porquê não considerar. E quanto as técnicas de Fūton e Raiton, que são consideradas mais velozes, para mim não seria muito problema, visto que o próprio Byakugan permitiria uma análise antecipada dos jutsus antes deles serem lançados, pois seu usuário estaria enxergando todo o processo decorrente do elemental no Sistema de Chakra, então bastaria ter reflexo suficiente para estender da mão antes de ser atingido, além de que nem todos os Raitons e Fūtons são super rápidos. Ademais, foi dito ainda no Clássico que o Jūken pode destruir qualquer coisa feita de chakra, e temos dois exemplos do Punho Gentil dividindo jutsus através de Neji, portanto isto está longe de ser algo novo.