Nossa cara, você não tem ideia do quanto está errado.
Que eu saiba, o único motivo do braço do Minato não ter se regenerado foi ele ter sido mandado pra outra dimensão pelo Kamui do Kakashi.
O Corpo Edo vai se Regenerar independente do Dano. Se o Braço foi para outra Dimensão, logo o corpo vai Entender que o Braço não vai voltar e vai simplesmente criar outro. Nem o Jinton conseguiu burlar a Regeneração do Edo, pq aquilo é papel e pode ser Criado mais para suprir o Perdido.
Essa imagem é prova do que eu disse, a Alma de Minato estava sem Braços, provando que o Dano foi Espiritual. Até onde sei o Kamui não causa danos na alma, alias EU SEI QUE NÃO, basta vez o Caso de Kakashi vs Deidara.
E essa cena do Minato tendo seu braço cortado pelo bastão de Gugoudama do Madara Jin serviu como prova pra mostrar que o Oumyouton do Madara Jin era superior e mais avançado que o de Obito Jin.
Tudo que foi dito foi que Madara era mais Forte que Obito, porém Minato provavelmente se baseou na Quantidade de Chakra com seu Sensor. Sim, Madara tinha mais Charka Biju que Obito, porém no quesito Manipulação e Versatilidade com Gudodamas Obito foi bem mais explorado que Madara.
Já Madara Jin, só podia ser ferido/ ter Gugoudamas tocadas por chackra do próprio Rikudo Senin, conforme Naruto e Sasuke mostraram após tê-lo recebido do próprio Hagoromo.
As fraquezas de Madara e Obito eram as mesmas. Tu já está entrando na área da imaginação e deixando de lado o Dito/Mostrado.
Aquilo, de Minato tendo braço cortado por Madara, só ocorreu porque era um teste. Minato deixou que acontecesse.
Correção, contra Obito foi isso, os Hokages estavam se pondo em Perigo desnecessário por conta de seus Corpo Imortais. Porém contra Madara ele só foi pego, ponto, além de que quase feriu seus Companheiros com essa ação.
RESUMINDO: O Senjutsu protegeu o CORPO FÍSICO de Minato contra o Onmyoton, mas não sua Alma.