Os 5 mais inteligentes:
Itachi
Tobirama
Orochimaru
Shikamaru's (Pai dele e seu filho)
Minato
Talvez muitas pessoas coloquem o Shikamaru em primeiro, no entanto, ele tem apenas um raciocínio lógico muito alto que é 240, mas inteligência não é somente QI e esse termo vem sendo estudado faz tempo e não tem uma definição exata para inteligência.
Itachi fica em primeiro justamente por ser um gênio, pensar como um Hokage com 7 anos, se sobressair em tudo e outros feitos que vocês já sabem.
Tobirama é outro gênio, criador de jutsus, extremamente analítico e etc...
Orochimaru é outro gênio, dispensa comentários, tá vivinho até hoje.