É uma questão Elementar meu caro, levantada desde o Clássico, vejamos o que Itachi disse naquela época:
Depois da formação de Konoha, qual a diferença entre os Uchiha e os Senju? Obito e Madara disseram que os Senju queriam o controle, mas isso é uma inverdade, pois sequer existia mais Clã Senju.
O Clã se desfez depois da fundação da vila, deixaram de ser Shinobis do Clã senju para serem Shinobis da vila da Folha. Enquanto que os Uchihas cada vez mais valorizaram seu Clã acima de tudo, querendo mais e mais poder para eles próprios, em vez da vila.
O que o manga fala sobre Kagami?O que o manga fala sobre Shisui?O que o manga fala sobre Itachi?É a mesma historia pra todos eles, deixaram seu clã abaixo da vila em vez de acima, e herdaram a vontade dos Shinobis de Konoha( Ideologia Senju ). Se os Senjus deixaram de existir como Clã e os Uchihas se priorizavam acima de tudo, Itachi ficou num Meio Termo:
OBS: Manga deixou claro que Uchihas tem problemas mentais, então compreendam os coitados.