Gente o lee nao sabe moldar chakra, o que o impede de fazer selos de maos e usar ninjutsus, MAS, ele sabe acumular e manter um fluxo de chakra constante, tanto é que ele sabe andar sobre a agua, paredes e etc.... ele possui esse nivel de controle de chakra.
Para usar o rinnegan precisa só controlar o chakra, nao precisa moldar (usar selos) ou nada muito complexo
Lembrem-se que o Rikudou sennin, Kaguya e cia nao usavam selos de maos para nada e mesmo assim possuiam poderes incriveis
Se o lee com o rinnegan arrumasse um poder como o Limbo ou Shinra tensei eu acho que ele ficaria mais apelao, se fosse algo como o Ameno ou Super gakido (momoshiki) eu acho que ele só ficaria mais versatil