Naruto e Sasuke ainda possuem os Chakras de Ashura e Indra? Sim, porque os resíduos cármicos só podem se dissipar depois da morte.
Mesmo que as pessoas alcancem a libertação cármica em vida, isso não vai desfazer a reencarnação atual, nem vai desfazer as reencarnações que ocorreram no passado, apenas vai impedir que a reencarnação ocorra no futuro em novos seres.
@ItaloHyuuga, eu criei um tópico sobre isso aqui no fórum. Aqui está o tópico:
https://www.forumnsanimes.com/t75150-esclarecimento-sobre-reencarnacoes