Mesmo em se tratando de técnica, habilidade, é difícil de comparar.
O naruto tem o feito de levar o controle de chackra ao extremo, distribuindo o chackra pra milhares de ninjas e os mantendo em perfeito equilibrio. Além disso, instantaneamente adaptou (mesmo q tenha ajuda dos Bijuus) seu FRS às liberações únicas de chackra de cada Bijuu.
O Sasuke, por outro lado, sempre mostrou bons feitos nessa área, com auxílio do Sharingan. Mais pro final, um dos maiores feitos de habilidade foi unir os chackras das bijuus em 1, fazendo um processo reverso ao do Rikudou, sendo elogiado pela Kurama.
Uma coisa q atrapalha como se vê o Naruto é a personalidade dele, com o estilo meio bobão.
Uma situação interessante pra essa análise é q quando eles faziam jutsus combinados (Enton FRS), quem ajustava seu chackra pra sincronizar era o Sasuke. Não q o Naruto não fosse conseguir, mas enfim...
Entre os dois, vou de Sasuke.
No corpo a corpo, dou um voto pro Naruto, em especial por ter dominado o Kawazu Kumite, um estilo muito interessante de Taijutsu. O sasuke tem um taijutsu bem desenvolvido mas é comum, tanto q ele utiliza Kenjutsu e Shurikenjutsu como complementos.