Sobre genjutsus, é bom avaliar quem se consegue atingir com o Gen, o q o Gen faz e o quão fácil é liberar alguém do mesmo.
Pensando em quem se consegue atingir, o Genjutsu: Rinnegan é superior. Além de ser castado com um olho mais poderoso, ele pegou 9 alvos a longa distância. Enquanto isso, o Tsukuyomi é de curta distância e causa um baita desgaste no usuário, Itachi.
Segundo, quanto ao q o Gen Faz, não existe comparação, o Tsu é muito mais poderoso. Manipulação completa de tempo dentro do gen.
Terceiro, sobre sair do Gen, tbm entendo q Tsukyomi ganha. Enquanto nele, não adianta ir 1 minuto depois liberar o aliado, pq ele já foi torturado por incontáveis dias lá dentro, o Genjutsu:Rinnegan, a priori, poderia ser liberado normalmente.
Levando os três em conta, entendo q o Gen Rinnegan é mais fácil de usar, por permitir longa distância e não desgastar o usuário, enquanto o Tsukuyomi é mais restrito, porém bem mais letal.