Eu acredito que sim.
Veja, a Totsuka é dita como capaz de selar a "Alma do alvo num mundo de Genjutsu". A ALMA, apenas isso.
O Yamata foi todo absorvido, isso apenas pq ele não era um corpo físico natural, mas sim uma massa de chakra( Parecido com as Bijus ) feito do espirito do orochi que residia no Fuin.
Ou seja, a Totsuka não pode selar objetos Físicos naturais, como uma pedra por exemplo. Digamos que Itachi empunhá-la a Tenten, seus corpo não seria absorvido, apenas sua Alma.
E a Kusanagi, é um item Físico, ou seja, ela não poderia ser selada junto da Alma de Orochi.
Nesse caso, onde ela esta? Simples, onde sempre esteve, dentro da Alma de Orochimaru. E como Orochi tem fragmentos de sua Alma espalhados por vários Juins, ele pode invocá-la de qualquer um deles( Como atualmente, ele saiu do de Anko ).
Não acham mesmo que Orochimaru guarda uma Espada dentro de seu Estomago né? Apesar dessa técnica nunca ter sido citada, tratasse claramente de um Fuin que deixa determinado alvo selado dentro de si.
Exemplos além da Kusanagi:
Resumindo, qualquer corpo que possuir a Alma de Orochimaru vai ser capaz de "Invocar" a Espada, já que ela está "Selada" junto de sua Alma. Casos parecidos:
- Totsuka de Itachi: Sendo dita como um item externo, ou seja, uma ferramenta como a própria Kusanagi. Itachi foi capaz de usa-la mesmo em sua Forma Edo, ou seja, a arma estava selada junto de sua Alma.
- Ferramentas de Kin e Gin: Mesmo caso acima.