Shizune não acompanhou Tsunade em sua viagem depois da morte de Dan
Shizune é a sobrinha de Dan Kato, o namorado de Tsunade. Algum tempo após a morte de Dan, Shizune cogitou ir junto com Tsunade para deixar Konoha, mas por algum motivo Shizune decidiu ficar em Konoha e utilizar o que aprendeu com sua mestra para ajudar o povo de Konoha. A ligação entre Tsunade e Shizune não enfraqueceu, acima de tudo, tanto que antes de Tsunade se tornar Hokage, ela visitava a vila para saber informações de sua discípula. Apesar de estarem separadas por tanto tempo, continuam inseparáveis.
Há um grupo de Uchihas vivos em Konoha que estão sendo cuidados por Shimura Danzou.
Quando o clã Uchiha começou a planejar derrubar Konoha, Itachi, como um ANBU, foi encarregado de espionar a aldeia. Sabendo que um golpe de Estado iria acabar dando início a uma nova guerra shinobi mundial, Itachi começou a espionar os Uchiha em vez disso, e passou a transmitir as informações para o Terceiro Hokage e os anciões de Konoha. Embora o Terceiro Hokage tenha decidido compreender as razões dos Uchiha, a fim de encontrarem um modo pacífico para resolverem a situação, Danzō Shimura se encontrou secretamente com Itachi Uchiha e o induziu a escolher entre a vida dos membros do seu clã ou do seu irmãozinho. Mas como havia um pequeno grupo de Uchihas que eram leais a Konoha, sem falar nas crianças Uchihas que não tinham nada haver com a rebelião Uchiha, Itachi disse que mataria grande parte do Clã Uchiha, mas deixaria quem não tinha nada haver com a revolta, Danzou aceitou a proposta dizendo que esses Uchihas(s) iriam ser propriedade dele e que ele iria ensinar eles a serem leais a Konoha.
Antes da fatídica noite chegar, Itachi descobriu a existência de Tobi que estava tentando reacender as chamas da guerra em Konoha. Em troca de não atacar Konoha, Itachi se ofereceu para ajudá-lo a reivindicar a vingança contra os Uchiha, que viraram as costas para ele décadas antes, fazendo Tobi concordar. Itachi massacra grande parte do seu clã durante a noite, deixando um grupo vivo junto com seu pequeno irmão Sasuke Uchiha.
Izumi Uchiha, uma das sobreviventes se recusou de acreditar que Uchiha Itachi teria feito aquela brutalidade contra seu clã e apesar de trabalhar para Shimura Danzou atualmente, ela tenta descobrir meios de descobrir a verdade e acabar sobre o pequeno "reinado" que Danzou possui sobre os sobreviventes de seu clã.
Baki está morto, Hayate está vivo e Yugao está grávida.
Graças ao Yamanaka Inomin durante a invasão em Konoha, ele foi capaz de salvar Hayate de morrer nas mãos de Baki. Graças a esse feito, Hayate e Yugao se casaram oficialmente e ambos tiveram um filho chamado Yuta que atualmente possui 3 anos.
Zabuza e Haku estão vivos.
Zabuza acaba enfrentando um grupo de gennin, composto por Inuzuka Ben, Inuzuka Shinshi e Inuzuka Francisco com auxilio de um Jounin. Por esse motivo acaba se ferindo e teve que recuar junto com Haku. Mais tarde, Zabuza e Haku se encontram com um pequeno grupo de ninjas onde encontram Senju Evyl, mas apesar do conflito, ninguém chegou a morrer.
Exame Chunnin e suas mudanças
Hyuuga Neji não foi convertido pelo conversa de Uzumaki Naruto já que nunca chegou enfrentar ele, acabou perdendo de forma humilhante para Temari e acabou alimentando ódio em seu coração já que sempre foi visto como gênio e foi derrotado de forma fácil. Naruto e Sasuke se enfrentaram no Exame Chunnin e Sasuke foi o vencedor se tornando um Chunnin oficialmente, enquanto que Shikamamu foi derrotado facilmente e não conseguiu mostrar seu valor.
Rock Lee não enfrentou Gaara, logo não se feriu gravemente. Enquanto que Shikamaru e Temari nunca se conheceram.
Invasão de Orochimaru e Morte de Hiruzen
Quando a invasão em Konoha começou, Hiruzen foi forçado a lutar contra Orochimaru, que se infiltrou na vila e planejou destruir Konoha inteira, podendo matar Hiruzen e raptar Sasuke. Logo após a batalha começar, Orochimaru ressuscita Hashirama, Tobirama e Mito, de modo que Hiruzen podia sentir o prazer de lutar contra seus antigos professores. Inuzuka Ben e Senju Nakarama conseguiram-se infiltrar para ajudar Hiruzen já que Inuzuka Ben conseguiu cancelar a barreira do Quarteto do Som já que xingou Tayuya de "baranga" a deixando irritada ao ponto de perder a concentração, mas nada disso conseguiu impedir a morte de Sarutobi Hiruzen que morreu nos braços do jovem garoto Senju Nakarama.
Orochimaru acabou recuando sem nenhum ferimento já que não teve seus braços selados pelo Shinigami.
Amegakure e Konoha
Um grupo de ninjas liderados por Yamanaka Inomin foram até Amegakure entregar uma mensagem para Hanzou e acabaram descobrindo indícios que ele estava morto. Vendo isso, Konan encurralou eles e esteve prestes a matar o grupo, mas reforços chegaram impedindo de Konan de cumprir sua missão. Graças a isso, Konoha desconfia do que está acontecendo em Amegakure.
Nara Shikamaru
Shikamaru não virou Chunnin e durante uma luta com Uchiha Misaki, acabou ganhando queimaduras em sua pele. Esteve próximo a entrar na Anbu Ne, mas Akimichi Chouzu conseguiu evitar que isso aconteça.
Hyuuga Neji na Akatsuki
Orochimaru recriou o Rinnegan Imperfeito a partir do chakra de Sasuke e Hashirama
Durante suas pesquisas, Orochimaru conseguiu criar um doujutsu semelhante ao Rinnegan e fez um experimento humano que fosse capaz de aguentar o doujutsu. Apesar de parecer um sucesso, o poder do doujutsu ainda não consegue se comparar com o verdadeiro Rinnegan e o "experimento humano" não pode viver uma vida normal, ficando dependente de remédios e apoio médico.
Espada Kiba
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https://myanimelist.net/profile/Ben_Ikneg
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