Bom, o Izanami em si não faria tanta diferença contra o Koto. O usuário ainda precisaria criar as condições e tal.
Agora o Izanagi é algo discutível.
À favor do Koto, temos que o usuário de Izanagi pode ser colocado em genjutsus, isso ficou claro em Danzou v Sasuke. Nesse viés, se o usuário do Koto instigasse a ordem: faça a ação que mais te atrapalhe no momento, o usuário do Izanagi acabaria cancelando o jutsu e se matando. No entanto, aí vem a questão. O Izanagi reverte resultados negativos para o usuário, resetando a realidade deste para o momento da ativação do jutsu. Será que o Izanagi reverteria essa ordem do Koto de forma automática, ou necessitaria da consciência do usuário pra fazer o reset? Eu entendo que é o segundo, que o usuário necessita de agir conscientemente pra reverter as situações, o que seria impossível sob o Koto Amatsukami.