Com conhecimento total para ambos e sem o Chakra do Rikudou para o Obito, creio que ele ficaria completamente na defensiva. Seu Kamui seria capaz de mantê-lo intangível por, em teoria, 10 minutos consecutivos, mas não conseguiria mandar Sasuke para outra dimensão se ele estivesse usando o Susanoo, devido ao enorme tamanho. Aliás, Sasuke poderia simplesmente usar o Ame-no-Tejikara para escapar. Seria um combate chatinho para ambos lados, quem cometesse o pior erro primeiro perderia.
Sasuke parece ter mais recursos para ataque, mas o Kamui é uma técnica altamente versátil na parte defensiva, poderia muito bem ser considerado uma defesa absoluta. Já na parte ofensiva, Obito não parece ser muito bom.
Mas considerando que o Mangekyou Sharingan gasta muito chakra do usuário, creio que seu uso excessivo na batalha seria o motivo da derrota do Obito. Com chakra do Rikudou, já veria o Obito com mais opções de ataque e vitória. Mas sem isso, Sasuke deve vencer, embora com muita dificuldade.