Bom, vejamos quais são os personagens envolvidos nesta comparação.
De um lado, temos Sasuke e Shisui. Do outro, temos o seguinte:
Akatsuki
Nagato = Shinra Tensei, Chibaku Tensei, Invocações, Gakidou, Sensor, etc.;
Kakuzu = 5 Elementos;
Sasori = Nada;
Deidara = Bakuton;
Kages
Muu = Jinton, Indetectável, Sensor;
Gengetsu Hozuki = Genjutsu Campal, Suiton;
Sandaime Raikage = Velocidade, Durabilidade;
Rasa = Sakin;
Jinchuurikis
Todos possuem grande poder destrutivo (Bijuudama);
Outros
Asuma = Katon, Fuuton;
Chiyo = Nada;
7 Espadachins da Névoa = Matança Silenciosa;
Haku = Hyouton;
Hanzou = Veneno;
Kimimaro = Shikotsumyaku;
E mais alguns outros menos relevantes.
E o que temos do lado dos Uchihas?
Sasuke = Katon, Raiton, Enton, Genjutsu, Chibaku Tensei, Gakidou, Ame-no-Tejikara, Portal, Kuchiyose: Aoda e Garuda;
Shisui = Katon, Shunshin, Susanoo, Kotoamatsukami;
Shisui, mesmo considerando o Susanoo, acabaria sendo derrotado pelos mais fracos. Os 7 Espadachins da Névoa devem dar conta, senão, só chamar mais alguns que ele seria derrotado rapidamente. Já o Sasuke, mesmo que comece usando seu poder máximo, faça Kage Bunshins e abuse do Susanoo, dificilmente conseguiria lidar com um grupo formado pelos Kages + Jinchuurikis ou Akatsukis. A dupla poderia tentar usar o KA do Shisui para controlar 2 inimigos e torná-los aliados, mas nem sei… mesmo que peguem os dois mais fortes da equipe adversária ainda estariam em desvantagem. As chances de vitória deles são quase nulas.