Talvez, mas creio que não.
Embora tenham tendência a se perder no ódio as transmigrações de Indra não necessariamente são más.
As transmigrações de Indra eram incitadas ao combate contra as de Ashura principalmente por causa do contexto em que elas viviam (as Guerras entre os Clãs, Uchihas estavam sempre enfrentando os Senjus) e por causa disso elas estavam sempre em busca de mais poder (como diz o Zetsu) para superar o rival e assim tentar conseguir a supremacia.
Sasuke não viveu essa era, Sasuke é fruto do que fizeram com ele, Itachi manipulou ele a sentir ódio, depois disso Orochimaru, Obito e etc, de alguma forma contribuíram pra deixar ele ainda pior. Ser transmigração de Indra joga um papel menor nessa história do que essa manipulação que ele sofreu.
Se deixassem ele quieto lá no canto dele vivendo com o irmão e a família dele dificilmente ele faria alguma coisa ao meu ver visto que a natureza dele parecia pacifica antes do Itachi fazer ele despirocar, afinal o Rikudou disse que Sasuke ficou daquele jeito por que o amor que ele tinha no passado (pelo irmão dele em especial) virou ódio, se o Itachi e os outros Uchihas ficassem tranquilos provavelmente Sasuke iria ficar na dele pois n teria o gatilho que "enlouqueceu" ele.