Bom, na minha opinião, seja considerando o que foi mostrado sobre os dois personagens ou seja especulando, Sakura é superior em todos os casos. Enquanto ela está facilmente a par de Tsunade, que estava entre os Sannins Lendários, duvido muito que o Neji iria muito além do que o Hiashi foi. E desde que provavelmente não haveria nenhum abismo evolucionário das versões que os personagens tinham na guerra e a versão que eles estão agora, poderíamos muito bem considerar Sakura da Guerra vs. Neji da Guerra, situação na qual ela era superior e, portanto, continuaria sendo superior atualmente. A não ser com um JS versão The Last combinado com Hakke Kushou ou outros jutsus dos Hyuugas.
Concordo parcialmente com o que o
@Espírito da Floresta disse, mas como não quero ser estraga prazeres, devo dizer que seria uma boa ideia reinventar esse tópico na área Naruto para uma discussão de quão poderoso Neji seria caso continuasse vivo.