Pelo que eu entendi, o Naruto, através do Modo Sennin dos 6 Caminhos, conseguiu aprender todas as Transformações da Natureza, por isso ele é capaz de usar qualquer Kekkei Genkai elemental. Não é muito diferente do Rinnegan, que também concede ao usuário um aprendizado "mágico" sobre todos os elementos. Ele, aparentemente, é capaz de usar as técnicas das outras Bijuus através do Modo Sennin dos 6 Caminhos, não lembro dele ter usado alguma habilidade deles sem isso, embora eu não duvide. E, só por via das dúvidas:
Isso é o Modo Sennin dos 6 Caminhos :
Isso é o Modo Sennin dos 6 Caminhos mais o Modo Kurama :
Em resumo, é quase o mesmo esquema de combinar o Modo Sennin com o Modo Kurama. Com a principal diferença sendo que, atualmente, o Naruto sempre é retratado usando o Modo Sennin dos 6 Caminhos ao ativar o Modo Kurama;
Modo Sennin combinado com Modo Kurama :
Sobre ele ter que pedir permissão para usar. Pode ser que sim ou pode ser que não. Toda vez que ele usou as técnicas delas, ele pediu chakra, se não estou enganado. E na única vez em que elas não podiam doar esse chakra para ele, por estarem seladas pelo Chibaku Tensei do Sasuke, o Naruto não usou o chakra delas (embora existam outras explicações diversas). Ele conversa telepaticamente com as Bijuus, então nem dá pra saber se ele pediu ou não ajuda quando estava lutando contra a Delta. De qualquer forma, ele pode usar qualquer Kekkei Genkai que queira, então acho que nem existe essa necessidade de pedir permissão. Porém também reconheço essa possibilidade dele ter selado parte do poder de cada Bijuu há muito tempo para usar apenas quando for necessário. Por mim, eu acredito mais que ele pode usar livremente mesmo...