Tsunade ter mais chakra não significa nada quando Jiraiya tem um chakra muito mais poderoso e, principalmente, possui recursos para usar todo esse chakra de maneira ofensiva por conta própria.
Lembrando que Jiraiya base já possui muito chakra, em Modo Sennin suas reservas aumentam de maneira vertiginosa, além de contar com Fukasaku e Shima, sendo que apenas um desses é capaz de summonar 3 grandes gamas com facilidade (um já requer muito chakra)
O Modo Sennin do Jiraiya é a fusão de 3 enormes reservas de chakra, sendo continuamente abastecida Energia Natural. Jiraiya até Hoje é o único pode abastecer as reservas enquanto luta.
Tsunade possui muito chakra, mas em uma qualidade muito inferior, sendo que todo esse potencial de chakra serve basicamente para mante-la em luta, considerando o gasto massivo que é gasto em técnicas de regeneração.
Velocidade? Isso aqui é sandice pura, Tsunade é uma Shinobi com velocidade media para boa, nem de muito longe ela se compara ao um Sennin user.
Tudo que vimos na luta com Madara foi:
- Madara (clone) se deixando ser acertado para pegar Tsunade de surpresa e apresentar o Mokubunshin
-Tsunade acertando um Madara que estava com Susano'o ativo (nesse caso Madara não precisa reagir porque a defesa tanka pra ele)
Isso de Tsunade acompanhar o Raikage é pura mongolice, não merece nem comentários. Jiraiya por outro lado, era tão rápido que sequer dava reação aos corpos de Pain no 1x1.
Não faz nenhum sentido Tsuande passar de uma Ninja com velocidade mediana, para alguém mais veloz que um usuário de Modo Sennin. Se ela tivesse 1/3 dessa velocidade, não teria sido acertada por 100% dos golpes lançados contra ela nesse mangá.
Sobre resistência, Jiraiya é infinitamente mais resistente se tratando de durabilidade física, já que usuários de Modo Sennin tem a pele extremamente rígida, tornando seu corpo muito mais durável em comparação a Ninjas comuns como Tsunade. A Sannin precisaria regenerar golpes que sequer arranhariam Jiraiya.
O que Tsunade possui é uma regeneração capaz de mitigar danos, não confunda as coisas. Então dizer que Tsuande é mais resistente, é uma meia verdade e apenas depende a qual aspecto estamos nos referindo. Lembrando que Base Jiraiya tem maior pontuação de resistência física que Tsuande.
De qualquer forma, toda essa "resistência" da Tsuande é usada apenas para compensar suas deficiências em combate, ela literalmente não consegue evitar nada dos inimigos, de forma que precisa usar uma regeneração para apenas se manter em combate.
De resto, não vejo qualquer comparação que possa ser feita, existe uma enorme lacuna de habilidades separando Tsunade do Jiraiya, e isso até mesmo se tratando de Taijutsu, já que Kawazu Kumite é muito mais avançado que os golpes previsíveis da Tusande.