Pois é. Aquela pág ali que o Ellos trouxe ali, implicitamente diz que Tsunade continuou com tais estudos em Konoha, só que (claramente) de forma mais ética e tal... Nesse contexto da pág, apenas se referia aos braços perdidos dos mesmos, mas de lá até Boruto passam uns bons anos... Então, provavelmente eles inventaram alguma forma de analisar o DNA dos ninjas pra ver se são compatíveis.
Tenho essa "teoria" por conta das armas científicas ninjas. No cerne, não há muita diferença... E o Jiraya fake do Amado só corrobora tal linha de pensamento.