Konan devia ter destruído o Rinnegan?

Quantos problemas seriam evitados...

Sim, mas a história não iria pra frente caso o Kishimoto fizesse isso, então ele só deixou lá mesmo.

Se não fosse do nagato ela provavelmente destruiria

Não ia dar benefício pro enredo, na visão do Kishimoto ao menos...

Deveria sim,mas para a história progredir ficaria difícil,Zetsu teria que explicar ao Obito toda a dinâmica das reencarnações de Indra e Ashura para que ele fosse coletar as células de Naruto e Sasuke para ter uma pequena chance de despertar o rinnegan.

Mesma coisa que dizer que o Tobirama devia ter destruído o sharingan do madara depois de ter pesquisado ele

Coisas assim não fazem sentido no quesito roteiro, precisa existir uma pontinha solta pra dar continuidade a historia

Não se destroem armas.

Se for pra escolher outras péssimas escolhas tenho um monte:

Itachi não deveria ter matado seu clã e deixado Sasuke buscar vingança contra ele.
Hiruzen deveria ter matado Orochimaru.
Nagato deveria ter matado caçado e matado Danzou depois que o mesmo apareceu com Hanzo.
Minato não deveria ter citado a sua suspeita de ser Uchiha Madara para ninguém
Obito não deveria ter seguido Madara após a morte de Rin.
Orochimaru deveria ter matado Nagato, Yahiko e Konan como sugeriu quando os viu.
Tobirama deveria ter deixado Hiruzen se sacrificar e ainda mandaria o Danzo e os conselheiros junto de brinde. Ou so nomeava Kagami como Hokage.
Hashirama devia ter destruido o corpo de Madara na ultima luta
Tobirama deveria ter matado Madara quando teve a chance.
Hogoromo não devia ter deixado tudo pra Ashura e ter criado um filho tão mimado quanto Indra.

Myrddin escreveu:

Se for pra escolher outras péssimas escolhas tenho um monte:

Itachi não deveria ter matado seu clã e deixado Sasuke buscar vingança contra ele.
Hiruzen deveria ter matado Orochimaru.
Nagato deveria ter matado caçado e matado Danzou depois que o mesmo apareceu com Hanzo.
Minato não deveria ter citado a sua suspeita de ser Uchiha Madara para ninguém
Obito não deveria ter seguido Madara após a morte de Rin.
Orochimaru deveria ter matado Nagato, Yahiko e Konan como sugeriu quando os viu.
Tobirama deveria ter deixado Hiruzen se sacrificar e ainda mandaria o Danzo e os conselheiros junto de brinde. Ou so nomeava Kagami como Hokage.
Hashirama devia ter destruido o corpo de Madara na ultima luta
Tobirama deveria ter matado Madara quando teve a chance.
Hogoromo não devia ter deixado tudo pra Ashura e ter criado um filho tão mimado quanto Indra.

Sasuke não devia ir aprender com Orochimaru...

MaioneseTARADA escreveu:

Myrddin escreveu:

Se for pra escolher outras péssimas escolhas tenho um monte:

Itachi não deveria ter matado seu clã e deixado Sasuke buscar vingança contra ele.
Hiruzen deveria ter matado Orochimaru.
Nagato deveria ter matado caçado e matado Danzou depois que o mesmo apareceu com Hanzo.
Minato não deveria ter citado a sua suspeita de ser Uchiha Madara para ninguém
Obito não deveria ter seguido Madara após a morte de Rin.
Orochimaru deveria ter matado Nagato, Yahiko e Konan como sugeriu quando os viu.
Tobirama deveria ter deixado Hiruzen se sacrificar e ainda mandaria o Danzo e os conselheiros junto de brinde. Ou so nomeava Kagami como Hokage.
Hashirama devia ter destruido o corpo de Madara na ultima luta
Tobirama deveria ter matado Madara quando teve a chance.
Hogoromo não devia ter deixado tudo pra Ashura e ter criado um filho tão mimado quanto Indra.

Sasuke não devia ir aprender com Orochimaru...

Madara deveria ter guardado os seus rinnegans para Obito.

Sobre o tópico,acredito que ela não destruiu por questões de roteiro e respeito ao amigo morto.