Eu vejo um combate nivelado, pra falar a verdade.
Sobre o Tajū Kage Bunshin, não acho que seria um grande problema para o Kakashi. Ele já demostrou a capacidade de liberar o Shiden pelo corpo:
Ele também fez isso nas novels, só dei o exemplo do anime de Boruto porque é mais fácil de visualizar mesmo. Enfim, essa é uma boa forma de limpar os Kage Bunshins do Naruto e de quebra ainda causar um dano no Naruto verdadeiro que estiver em campo.
Caso seja apenas o Rasengan base Kakashi pode responder com o próprio Shiden, mas concordo que, usando o Ōdama Rasengan e o Chōōdama Rasengan, Naruto forçaria o Kakashi a escapar de alguma forma. Mas não acho que seria efetivo no Kakashi, que tem um estilo de luta baseado em atacar com Bunshins, além de ser usuário de Moguragakure para pegar o oponente de surpresa quando ele estiver distraído com seus Kage Bunshins. Vale ressaltar que na forma base o Naruto não tem sensor, ou seja, combar Moguragakure e Raiton Kage Bunshin é uma ótima opção para o Hatake, que deixaria o Naruto atordoado e vulnerável ao Shiden, que tem a capacidade de facilmente dividir um corpo ao meio:
Já o Rasenshuriken, é sim uma boa opção, mas não acho que seria K.O. pro Kakashi. Apesar de ser rápido, o Kakashi também demonstrou uma ótima velocidade nas novels. Primeiro, ele conseguiu subjugar a Kahyō em combate, Kahyō essa que, como visto no último capítulo de Kakashi Hiden, humilhou o Yondaime Raikage em combate. Ou seja, a velocidade de reação dela era grande o suficiente pra se manter e até mesmo derrotar o Ay em combate, porém, mesmo assim, Kakashi ainda foi capaz de superar ela em combate. Já em Kakashi Retsuden, é confirmado que o Kakashi desvia de golpes que apenas usuários de Sharingan seriam capazes, confirmando que o Kakashi já não necessita mais do Sharingan para se manter em combate, por conta disso não acho que o Rasenshuriken seria um problema muito grande para o Kakashi. Ele pode, por exemplo, se aproveitar da vantagem elemental e usar aquele Katon que ele lança um enorme pássaro de fogo. Seria sim forte o suficiente para até mesmo superar o Rasenshuriken, já que além da vantagem elemental, esse Katon foi forte o suficiente para até mesmo superar sua fraqueza elemental, evaporando um poderoso Suiton sem muitas dificuldades.
Sobre o Chakra, não tenho muito o que falar, há um abismo entre o Naruto e o Kakashi nesse quesito e caso a luta se prolongasse muito é óbvio que o Naruto sairia em grande vantagem. E sim, Naruto é bem rápido, porém o Kakashi não fica pra trás nesse quesito, sendo capaz de superar alguém que conseguia tranquilamente acompanhar o ritmo do Yondaime Raikage, além de ter uma reação superior a do Sharingan.
Kakashi tem bons recursos contra o Naruto, como exemplo aquela técnica semelhante ao Kirin que ele fez com uso do Shiden, além de ter mostrado uso de Genjutsus em alguns momentos para abrir a guarda do oponente, que na base o Naruto não possui recursos para lidar com. Além do que foi citado acima, Kakashi ainda possui o Katon do pássaro gigante, que supera o principal elemental do Naruto, que é o Fūton.
Vejo sim boas chances para o Kakashi, principalmente prendendo o Naruto em Genjutsus, atordoando-o com Raiton Kage Bunshin e em seguida o finalizando com o Shiden. Mas é claro que é um combate nivelado, ambos tem boas chances de vencer, mas eu vejo algumas vantagens para o Kakashi.