Os portões não melhoram a qualidade do chakra em nada, apenas aumenta o chakra a disposição e aumenta o fluxo, isso é comparavel a fala do Neji quando viu o Sasuke e Kidomaru com Juuin ativado falando do Fluxo estar maior que o normal.
Ter mais chakra circulando pelo seu corpo pode ser muito bom, mas, tambem pode ser muito ruim e perigoso
Voce nao controlar precisamente o chakra voce pode gastar mais chakra que o necessario, ou seja, fora o desgaste dos Gates, voce ainda estaria jogando chakra fora colocando mais chakra que o necessario nas tecnicas sendo que alguns jutsus poderiam explodir ou nao funcionar corretamente
Quanto a genjutsu, nao vejo melhorando em nada