Mudaria muita coisa,Naruto com seu chakra colossal conseguiria controlar o rinnegan,Tobi não conseguiria recuperar o rinnegan,ele teria que enfrentar Bee+Naruto que estaria bem mais forte devido ao km1 e ao rinnegan+alguns outros ninjas,acho que mesmo com a ajuda do Kisame,as chances de Tobi conseguir são poucas.