O Minato simplesmente não quis matar o Bee ali. Eu acho que ele mataria o Bee e o Raikage ali se quisesse.
O Raikage tava ciente do poder do Minato, mas o teleporte pro Bee o pegou de surpresa. Minato mataria o Bee naquele instante pelo argumento do cara acima até.
Minato ao matar o Bee apareceria em cima do raikage de novo quando o raikage fosse pegar o corpo do irmão e finish him. O raikage é muito cabeça quente pra lidar com isso na hora ali.