Apesar de não existir nenhum feito concreto no mostrado, há indicios que genjutsu em sua maioria não são efetivos contra Otsutsuki:
- Sasuke nunca tentou colocar nenhum deles em um genjutsu, logo temos que deduzir que não seria efetivo. Há o fato também que doujutsus como Rinnegan do Momoshiki, naturalmente oferecem resistencia contra genjutsu oculares.
- Kaguya temia sua familia Otsutsuki, mesmo que ela tivesse conhecimento e capacidade de utilizar genjutsus poderosos como o Tsukuyomi Infinito.
- No anime, Urashiki já foi mostrado possuir conhecimento de como funcionava um genjutsu, logo tudo indica que Otsutsuki tem conhecimento da arte ilusória, considerando que Kaguya também tinha esse conhecimento pré-definido no anime, podemos deduzir que Otsutsuki em geral não são zé-ninguem para cair em qualquer genjutsu.
- Doujutsu como Byakugan são uteis contra genjutsu(s) em geral, digo isso porque Hinata já indicou no mangá que seria capaz de saber se determinada situação seria um genjutsu ou não quando se deparou com Tobi.
No mais, para cobrir as faltas de informações que o anime/mangá/filme tem, o certo seria considerar que eles são resistentes a genjutsus, mas tem gente que prefere acreditar que simplesmente esqueceram que genjutsu existe e que Otsutsuki são sucetiveis a cair em ilusões. No mais, eu acredito que eles são naturalmente resistentes graças ao seus doujutsus e as propriedades naturais de suas reservas de chakra. Mas cada um com sua interpretação.