Hitsugaya é um tanto superior. Notado até pelo Kyoraku como um gênio, sendo dito pelo mesmo que ultrapassaria ele em uma centena de anos (o que foi bem forçado e arrogante na minha opinião).
A bankai da Rukia tem o maior poder explosivo, mas a do Hitsugaya foi muito mais mostrada com controle e poder ressaltado desde sempre. Eu vejo a Rukia tendo uma chance mínima contra ele se ela conseguisse usar a bankai bem e acertasse, de resto, ele é totalmente superior a ela em todos outros atributos. Na bankai inclusive, se ela não consegue acertar um ataque muito crítico, o que seria muito difícil, até por ele provavelmente ter altíssima resistência a gelo, ela perde.
Ao meu ver a Rukia precisaria de uns 100 anos de treino solo ou uns 20 anos de treino pelos melhores tutores possíveis pra ela.
Quanto a qual zanpakutou é mais forte...
Hitsugaya foi melhor aproveitado em batalha, além da Rukia começar a mostrar poder mesmo lá no final só. Sinceramente, eu não vi muito potencial evolutivo pra bankai da Rukia, enquanto a do Hitsugaya, que é dita como a mais forte dentre as zanpakutous do tipo gelo (se não me engano tem uma passagem disso no mangá, não vi o anime), tem um poder ótimo, muito versátil. Hitsugaya adulto tem um poder de congelamento tremendo e altíssima versatilidade, coisa que a Rukia mostrou não ter na bankai dela.