Comentário do Comando foi bem bom.
Doujutsu: Sasuke tem apenas um MSE, Madara tem dois.
Madara > Sasuke (Madara tem dois)
Chakra: Madara sempre foi ressaltado como tendo muito chakra. Mesmo que o Sasuke também tenha bastante, ele foi mostrado sendo esgotado várias vezes já perto de seu auge (sem os poderes do rikudou). Fora o fato do Madara ter poderes em escala muito maior, mostrando possuir potencialmente tanto mais chakra que o Sasuke quanto o Hashirama teria mais que o Naruto (sem Kurama).
Madara > Sasuke
Auxílio: Chamei de "auxílio", no caso é o que pode auxiliar na batalha. Sasuke tem a Aoda ou um falcão pequeno (único mostrado) e o Madara a Kyuubi.
Madara > Sasuke
Arma: Kusanagi x Gunbai. A espada do Sasuke é usada com raiton, muito forte, mas a Gunbai do Madara em poucas aparições tem mais feitos com os combos de Uchiha return e é dita poder auxiliar katons também. Fora a resistência para lidar com a Katana.
Madara > Sasuke
Katon: Goukakyu x Gouka mekyaku... Maior katon do Sasuke precisaria ser cuspido 20x pra igualar com o maior katon do Madara.
Madara > Sasuke
Raiton: Madara não foi mostrado usando raiton, enquanto o Sasuke é muito com bom o elemento.
Sasuke > Madara
Taijutsu: Sasuke tem um braço faltando, se tivesse os dois até poderia vencer.
Madara > Sasuke
Velocidade: Sasuke se mostrou bem mais rápido, conseguindo cegar alguns oponentes durante a série de Naruto e sendo ressaltado algumas vezes pela mesma.
Sasuke > Madara
Pra quem acha que o Sasuke usa katana com raiton e dá shunshin blitz no Madara, então isso seria: Velocidade > todos outros atributos e técnicas em Naruto.