@Paçoca do MatoBom, o que eu recomendo não são nem as Hackroms, mas os fangames mesmo. Esses os fãs constroem do zero no RPGMaker, geralmente ficam bem mais completos (Lista de pokemons até 8ª geração, Mega evoluções, Z-moves, etc). Recomendo:
1. Pokemón Reborn - A versão beta atual inclui o fim do jogo, no caso a elite dos 4 e campeão. São 18 lutas de ginásio, 1 pra cada tipo e os combates são muito mais difíceis. Essa dificuldade não vêm por meio de jogar os pokemon em LV absurdo, mas sim por construir os times dos npc cuidadosamente com estratégias em mente, levando em conta os efeitos de campo que eles introduziram ao jogo. O Reborn fez tanto sucesso que outros projetos usam o mesmo sistema de field effects e NPC com estratégia de time;
2. Pokemón Rejuvenation - É um dos fangames que comentei que se basearam no sistema do Reborn. Esse aqui dá uma opção de subir mais ainda a dificuldade, com o nível insano. Cada batalha de ginásio é um parto, mas quando tu ganha dá bem mais satisfação.
3. Pokemón Insurgence - Esse aqui é completinho. É mais difícil que games da franquia normal, mas não chega a ser um "jogo de xadrez" como Reborn e Rejuvenation. A história é bacana e o game é bem amplo, incluindo tudo até a 6ª geração, que era a geração atual quando o game foi finalizado.