Gamarinshou é o mais poderoso, ao meu ver.
Por outro lado, Tsukuyomi com manipulação de tempo do Itachi é tão mortal quanto o Gamarinshou e mais acessível em batalha. Isso porque o Itachi pode manipular a percepção do tempo livremente, conforme foi confirmado várias vezes pelo autor em diferentes situações. Ele consegue distorcer em níveis absurdos, como 2 segundos demorarem 2 semanas para a pessoa afetada pela distorção da percepção do tempo.
É isso que torna o Tsukuyomi do Itachi tão mortal e diferente dos outros. Com intenção de matar e em um 1v1, simplesmente não é justo com nenhum oponente, incluindo o Sasuke, Obito e o próprio Madara. Isso porque a abordagem, se o intuito é matar, é diferente. Perceba que o Itachi sequer ativou a manipulação de tempo contra o Sasuke, quando o deixou vencer a luta planejada por ele. Contra o Kakashi, ele simplesmente optou por 2 semanas, quando poderia ter optado por décadas e destruído a mente do Kakashi. Nessas horas, pesa o fato de que o Itachi é, conforme as próprias palavras dele, que não poderiam ser mais claras e incisivas: "Uchiha Itachi de Konoha".
Sendo assim, o Tsukuyomi de um Itachi sério tem uma abordagem diferente quanto ao HAX da manipulação livre do tempo. Ele pode, sem a menor dificuldade, fazer 10 segundos no mundo real passarem em 0,00001s no mundo do Tsukuyomi. O ninja que caiu no genjutsu não teria a mínima chance de quebrá-lo ou de ter qualquer reação. E é exatamente por isso que Naruto não é DBZ, que é decidido na base de "quem tem mais poder de luta" é um deus invencível e o outro nada pode fazer, pois nada dará certo graças a sua inferioridade inata. Apesar de, claro, não raramente detectamos alguns com síndrome de DBZ por aqui. O que é um delírio, na minha opinião. Sou mais fã de DBZ do que de Naruto, mas é sempre bom saber separar as obras e manter o pézinho no chão.
Note-se que o conceito é o mesmo do Gamarinshou: a distorção da percepção do tempo tem o poder de te desconectar da realidade, e é exatamente isso que ela faz. É um genjutsu tão mortal quanto, e definitivamente é o melhor para um 1v1. Uma vez dentro, não tem como counterar nenhum dos dois. Você não está mais controlando seu corpo e seu chakra, na prática.
Kabuto colocou uma córnea de cobra mesmo sendo um sensor de chakra poderoso. Acho que isso dispensa comentários e dúvidas sobre quão fácil um Tsukuyomi pega, quão mortal é, e qual é o tamanho da prevenção necessária para uma ameaça desse nível.
Por outro lado, Gamarinshou, uma vez pronto, é superior ao Tsukuyomi do Itachi em termos de poder, podendo acabar com vários alvos ao mesmo tempo. Não pode ser subestimado.